自動萃取儀可廣泛應用于環保、醫藥等領域需要液－液萃取的實驗室。應放置在干凈整潔、通風良好的房間內，工作臺應堅固平穩，儀器接地良好。當使用對人體不利的有機溶劑作為萃取劑時，建議將萃取儀放置在通風櫥內，以減少對人體的傷害。